Identification of Tilletia species using rep-PCR fingerprinting technique
Identifikacija vrsta roda Tilletia rep-PCR fingerprinting tehnikom
2011
Аутори
Župunski, VesnaIgnjatović-Micić, Dragana
Nikolić, Ana
Stanković, Slavica
Jevtić, Radivoje
Lević, Jelena
Ivanović, Dragica
Чланак у часопису (Објављена верзија)
Метаподаци
Приказ свих података о документуАпстракт
Analyzing 167 non-processed seed samples of wheat, it was found that 145 samples (86.8 %) were contaminated with Tilletia species, while 22 (13.2 %) samples were not contaminated. By using rep-PCR fingerprinting technique, it was found that DNA isolates of T. tritici originated from Serbian wheat samples had 80 % similarity with positive control for T. tritici. One isolate shared similarity of 60% with T. tritici, T. controversa and T. laevis. It was supposed that this isolate belongs to T. bromi. Isolate of T. laevis shared a similarity of 70 % with isolates of T. tritici and T. controversa, while T. walkeri was more than 10 % similar with T. tritici, T. controversa and T. laevis. Although T. controversa and T. tritici had high percent of genetic similarity, they were clustered separately. Our results suggest that rep-PCR fingerprinting could be a useful tool for monitoring presence of morphologically similar Tilletia species in wheat production areas.
Istraživanjem kontaminiranosti uzoraka semena pšenice teleutosporama Tilletia vrsta, utvrđeno je da je od 167 uzoraka nedorađenog semena pšenice, bilo kontaminirano 145 (86,8%), dok su 22 uzorka (13,2%) smatrana nekontaminiranim. Identifikacija Tilletia vrsta izvršena je rep-PCR fingerprinting tehnikom. Izolati prikupljeni na teritoriji Republike Srbije identifikovani su kao T. tritici, s obzirom da su sa pozitivnom kontrolom imali genetičku sličnost veću od 80%. Jedan od izolata koji je vodio poreklo iz opštine Apatin bio je oko 60% genetički sličan sa izolatima T. tritici, T. controversa i T. laevis. Pretpostavljeno je da pripada vrsti T. bromi. Genetička sličnost izolata T. walkeri i vrsta: T. tritici, T. laevis i T. controversa, iznosila je nešto više od 10%. Genetička sličnost T. tritici, T. controversa i T. laevis bila je oko 70 %. I pored visokog procenta genetičke sličnosti između T. controversa i T. tritici, napravljena je razlika među njima, što rep-PCR fingerprinting tehniku... čini veoma podesnom za praćenje prisustva morfološki sličnih Tilleria vrsta prilikom kontrole kvaliteta semena pšenice.
Кључне речи:
identification / rep-PCR fingerprinting / Tilletia tritici / Tilletia controversa / Tilletia laevis / Tilletia bromi / Tilletia walkeri / wheatИзвор:
Genetika-Belgrade, 2011, 43, 1, 183-195Издавач:
- Društvo genetičara Srbije, Beograd
DOI: 10.2298/GENSR1101183Z
ISSN: 0534-0012
WoS: 000292740400016
Scopus: 2-s2.0-79957958100
Колекције
Институција/група
FiVeRTY - JOUR AU - Župunski, Vesna AU - Ignjatović-Micić, Dragana AU - Nikolić, Ana AU - Stanković, Slavica AU - Jevtić, Radivoje AU - Lević, Jelena AU - Ivanović, Dragica PY - 2011 UR - http://fiver.ifvcns.rs/handle/123456789/1027 AB - Analyzing 167 non-processed seed samples of wheat, it was found that 145 samples (86.8 %) were contaminated with Tilletia species, while 22 (13.2 %) samples were not contaminated. By using rep-PCR fingerprinting technique, it was found that DNA isolates of T. tritici originated from Serbian wheat samples had 80 % similarity with positive control for T. tritici. One isolate shared similarity of 60% with T. tritici, T. controversa and T. laevis. It was supposed that this isolate belongs to T. bromi. Isolate of T. laevis shared a similarity of 70 % with isolates of T. tritici and T. controversa, while T. walkeri was more than 10 % similar with T. tritici, T. controversa and T. laevis. Although T. controversa and T. tritici had high percent of genetic similarity, they were clustered separately. Our results suggest that rep-PCR fingerprinting could be a useful tool for monitoring presence of morphologically similar Tilletia species in wheat production areas. AB - Istraživanjem kontaminiranosti uzoraka semena pšenice teleutosporama Tilletia vrsta, utvrđeno je da je od 167 uzoraka nedorađenog semena pšenice, bilo kontaminirano 145 (86,8%), dok su 22 uzorka (13,2%) smatrana nekontaminiranim. Identifikacija Tilletia vrsta izvršena je rep-PCR fingerprinting tehnikom. Izolati prikupljeni na teritoriji Republike Srbije identifikovani su kao T. tritici, s obzirom da su sa pozitivnom kontrolom imali genetičku sličnost veću od 80%. Jedan od izolata koji je vodio poreklo iz opštine Apatin bio je oko 60% genetički sličan sa izolatima T. tritici, T. controversa i T. laevis. Pretpostavljeno je da pripada vrsti T. bromi. Genetička sličnost izolata T. walkeri i vrsta: T. tritici, T. laevis i T. controversa, iznosila je nešto više od 10%. Genetička sličnost T. tritici, T. controversa i T. laevis bila je oko 70 %. I pored visokog procenta genetičke sličnosti između T. controversa i T. tritici, napravljena je razlika među njima, što rep-PCR fingerprinting tehniku čini veoma podesnom za praćenje prisustva morfološki sličnih Tilleria vrsta prilikom kontrole kvaliteta semena pšenice. PB - Društvo genetičara Srbije, Beograd T2 - Genetika-Belgrade T1 - Identification of Tilletia species using rep-PCR fingerprinting technique T1 - Identifikacija vrsta roda Tilletia rep-PCR fingerprinting tehnikom EP - 195 IS - 1 SP - 183 VL - 43 DO - 10.2298/GENSR1101183Z ER -
@article{ author = "Župunski, Vesna and Ignjatović-Micić, Dragana and Nikolić, Ana and Stanković, Slavica and Jevtić, Radivoje and Lević, Jelena and Ivanović, Dragica", year = "2011", abstract = "Analyzing 167 non-processed seed samples of wheat, it was found that 145 samples (86.8 %) were contaminated with Tilletia species, while 22 (13.2 %) samples were not contaminated. By using rep-PCR fingerprinting technique, it was found that DNA isolates of T. tritici originated from Serbian wheat samples had 80 % similarity with positive control for T. tritici. One isolate shared similarity of 60% with T. tritici, T. controversa and T. laevis. It was supposed that this isolate belongs to T. bromi. Isolate of T. laevis shared a similarity of 70 % with isolates of T. tritici and T. controversa, while T. walkeri was more than 10 % similar with T. tritici, T. controversa and T. laevis. Although T. controversa and T. tritici had high percent of genetic similarity, they were clustered separately. Our results suggest that rep-PCR fingerprinting could be a useful tool for monitoring presence of morphologically similar Tilletia species in wheat production areas., Istraživanjem kontaminiranosti uzoraka semena pšenice teleutosporama Tilletia vrsta, utvrđeno je da je od 167 uzoraka nedorađenog semena pšenice, bilo kontaminirano 145 (86,8%), dok su 22 uzorka (13,2%) smatrana nekontaminiranim. Identifikacija Tilletia vrsta izvršena je rep-PCR fingerprinting tehnikom. Izolati prikupljeni na teritoriji Republike Srbije identifikovani su kao T. tritici, s obzirom da su sa pozitivnom kontrolom imali genetičku sličnost veću od 80%. Jedan od izolata koji je vodio poreklo iz opštine Apatin bio je oko 60% genetički sličan sa izolatima T. tritici, T. controversa i T. laevis. Pretpostavljeno je da pripada vrsti T. bromi. Genetička sličnost izolata T. walkeri i vrsta: T. tritici, T. laevis i T. controversa, iznosila je nešto više od 10%. Genetička sličnost T. tritici, T. controversa i T. laevis bila je oko 70 %. I pored visokog procenta genetičke sličnosti između T. controversa i T. tritici, napravljena je razlika među njima, što rep-PCR fingerprinting tehniku čini veoma podesnom za praćenje prisustva morfološki sličnih Tilleria vrsta prilikom kontrole kvaliteta semena pšenice.", publisher = "Društvo genetičara Srbije, Beograd", journal = "Genetika-Belgrade", title = "Identification of Tilletia species using rep-PCR fingerprinting technique, Identifikacija vrsta roda Tilletia rep-PCR fingerprinting tehnikom", pages = "195-183", number = "1", volume = "43", doi = "10.2298/GENSR1101183Z" }
Župunski, V., Ignjatović-Micić, D., Nikolić, A., Stanković, S., Jevtić, R., Lević, J.,& Ivanović, D.. (2011). Identification of Tilletia species using rep-PCR fingerprinting technique. in Genetika-Belgrade Društvo genetičara Srbije, Beograd., 43(1), 183-195. https://doi.org/10.2298/GENSR1101183Z
Župunski V, Ignjatović-Micić D, Nikolić A, Stanković S, Jevtić R, Lević J, Ivanović D. Identification of Tilletia species using rep-PCR fingerprinting technique. in Genetika-Belgrade. 2011;43(1):183-195. doi:10.2298/GENSR1101183Z .
Župunski, Vesna, Ignjatović-Micić, Dragana, Nikolić, Ana, Stanković, Slavica, Jevtić, Radivoje, Lević, Jelena, Ivanović, Dragica, "Identification of Tilletia species using rep-PCR fingerprinting technique" in Genetika-Belgrade, 43, no. 1 (2011):183-195, https://doi.org/10.2298/GENSR1101183Z . .
Related items
Showing items related by title, author, creator and subject.
-
Resistance of some commercial winter wheat cultivars to Tilletia tritici / Otpornost nekih komercijalnih sorti pšenice prema Tilletia tritici
Staletić, Mirjana; Gudžić, Slaviša D.; Jevtić, Radivoje; Milovanović, Milivoje; Stevanović, Vesna M.; Rajičić, Vera; Knežević, Branislav P.; Nikolić, Katerina T.; Deletić, Nebojša R. (Matica srpska, Novi Sad, 2007) -
Efikasnost fungicida za tretiranje semena u suzbijanju Tilletia tritici na području severozapadne Bosne / Efficacy of fungicides for seed treatment against Tilletia tritici in North-Western part of Bosnia
Delalić, Zemira; Jevtić, Radivoje; Jogić, Vildana; Alibabić, Vildana (Institut za pesticide i zaštitu životne sredine, Beograd i Društvo za zaštitu bilja Srbije, Beograd, 2005) -
The influence of Tilletia spp. inoculum source and environmental conditions on the frequency of infected wheat spikes / Uticaj izvora inokuluma Tilletia spp. i uslova sredine na učestalost zaraženih klasova
Koprivica, Mirjana; Jevtić, Radivoje; Dulić-Marković, Ivana (Institut za pesticide i zaštitu životne sredine, Beograd i Društvo za zaštitu bilja Srbije, Beograd, 2009)